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Summary: Review Request: perl-bioperl-run - Perl interface to various bioinformatics applications https://bugzilla.redhat.com/bugzilla/show_bug.cgi?id=236877 panemade@xxxxxxxxx changed: What |Removed |Added ---------------------------------------------------------------------------- Flag|fedora-review? |fedora-review+ ------- Additional Comments From panemade@xxxxxxxxx 2007-04-18 05:21 EST ------- Review: + package builds in mock (development i386). + rpmlint is silent for SRPM and for RPM. + source files match upstream url 0f3fb1589062e857aaf7d5523c18f5ba bioperl-run-1.5.2_100.tar.gz + package meets naming and packaging guidelines. + specfile is properly named, is cleanly written + Spec file is written in American English. + Spec file is legible. + dist tag is present. + build root is correct. + license is open source-compatible. + License text is included in package. + %doc is present. + BuildRequires are proper. + %clean is present. + package installed properly. + Macro use appears rather consistent. + Package contains code, not content. + no headers or static libraries. + no .pc file present. + no -devel subpackage + no .la files. + no translations are available + Does owns the directories it creates. + no scriptlets present. + no duplicates in %files. + file permissions are appropriate. + make test outputs nothing. +Provides: perl(Bio::Factory::EMBOSS) perl(Bio::Installer::Clustalw) perl(Bio::Installer::EMBOSS) perl(Bio::Installer::Generic) perl(Bio::Installer::Muscle) perl(Bio::Installer::PAML) perl(Bio::Installer::Probcons) perl(Bio::Installer::TCoffee) perl(Bio::Tools::Run::AbstractRunner) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Amap) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Blat) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::DBA) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Exonerate) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Kalign) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Lagan) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::MAFFT) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Muscle) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Probalign) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Probcons) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Sim4) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::StandAloneFasta) perl(Bio::Tools::Run::Alignment::TCoffee) perl(Bio::Tools::Run::Analysis) perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Job) perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Job::soap) perl(Bio::Tools::Run::Analysis::Utils) perl(Bio::Tools::Run::Analysis::soap) perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory) perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory::Pise) perl(Bio::Tools::Run::AnalysisFactory::soap) perl(Bio::Tools::Run::Cap3) perl(Bio::Tools::Run::Coil) perl(Bio::Tools::Run::EMBOSSApplication) perl(Bio::Tools::Run::EMBOSSacd) perl(Bio::Tools::Run::Eponine) perl(Bio::Tools::Run::FootPrinter) perl(Bio::Tools::Run::Genewise) perl(Bio::Tools::Run::Genscan) perl(Bio::Tools::Run::Hmmer) perl(Bio::Tools::Run::JavaRunner) perl(Bio::Tools::Run::Mdust) perl(Bio::Tools::Run::Phrap) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Forester::SDI) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::LVB) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Molphy::ProtML) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Baseml) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Codeml) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Evolver) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::PAML::Yn00) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Base) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Consense) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::DrawGram) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::DrawTree) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Neighbor) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::PhylipConf) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtDist) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtPars) perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::SeqBoot) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::CSR) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::Puzzle) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::abiview) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::addquart) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::align2model) perl(Bio::Tools::Run::PiseApplication::alistat) 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