Please do not reply directly to this email. All additional comments should be made in the comments box of this bug report. Summary: Review Request: perl-bioperl - A package of Perl tools for computational molecular biology Alias: perl-bioperl https://bugzilla.redhat.com/bugzilla/show_bug.cgi?id=234573 panemade@xxxxxxxxx changed: What |Removed |Added ---------------------------------------------------------------------------- Flag|fedora-review? |fedora-review+ ------- Additional Comments From panemade@xxxxxxxxx 2007-04-03 06:36 EST ------- Review: + package builds in mock (development i386). + rpmlint is silent for SRPM and for RPM. + source files match upstream url 71f22246979ee5d6e19d547319962eea bioperl-1.5.2_102.tar.bz2 + package meets naming and packaging guidelines. + specfile is properly named, is cleanly written + Spec file is written in American English. + Spec file is legible. + dist tag is present. + build root is correct. + license is open source-compatible. + License text is included in package. + %doc is present. + BuildRequires are proper. + %clean is present. + package installed properly. + Macro use appears rather consistent. + Package contains code, not content. + no headers or static libraries. + no .pc file present. + no -devel subpackage + no .la files. + no translations are available + Does owns the directories it creates. + no scriptlets present. + no duplicates in %files. + file permissions are appropriate. + make test disabled. + Provides: perl(Bio::Align::AlignI) perl(Bio::Align::DNAStatistics) perl(Bio::Align::PairwiseStatistics) perl(Bio::Align::ProteinStatistics) perl(Bio::Align::StatisticsI) perl(Bio::Align::Utilities) perl(Bio::AlignIO) perl(Bio::AlignIO::bl2seq) perl(Bio::AlignIO::clustalw) perl(Bio::AlignIO::emboss) perl(Bio::AlignIO::fasta) perl(Bio::AlignIO::largemultifasta) perl(Bio::AlignIO::maf) perl(Bio::AlignIO::mase) perl(Bio::AlignIO::mega) perl(Bio::AlignIO::meme) perl(Bio::AlignIO::metafasta) perl(Bio::AlignIO::msf) perl(Bio::AlignIO::nexus) perl(Bio::AlignIO::pfam) perl(Bio::AlignIO::phylip) perl(Bio::AlignIO::po) perl(Bio::AlignIO::prodom) perl(Bio::AlignIO::psi) perl(Bio::AlignIO::selex) perl(Bio::AlignIO::stockholm) perl(Bio::AnalysisI) perl(Bio::AnalysisI::JobI) perl(Bio::AnalysisParserI) perl(Bio::AnalysisResultI) perl(Bio::AnnotatableI) perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory) perl(Bio::Annotation::Collection) perl(Bio::Annotation::Comment) perl(Bio::Annotation::DBLink) perl(Bio::Annotation::OntologyTerm) perl(Bio::Annotation::Reference) perl(Bio::Annotation::SimpleValue) perl(Bio::Annotation::StructuredValue) perl(Bio::Annotation::Target) perl(Bio::Annotation::TypeManager) perl(Bio::AnnotationCollectionI) perl(Bio::AnnotationI) perl(Bio::Assembly::Contig) perl(Bio::Assembly::ContigAnalysis) perl(Bio::Assembly::IO) perl(Bio::Assembly::IO::ace) perl(Bio::Assembly::IO::phrap) perl(Bio::Assembly::Scaffold) perl(Bio::Assembly::ScaffoldI) perl(Bio::Assembly::Singlet) perl(Bio::Biblio) perl(Bio::Biblio::Article) perl(Bio::Biblio::BiblioBase) perl(Bio::Biblio::Book) perl(Bio::Biblio::BookArticle) perl(Bio::Biblio::IO) perl(Bio::Biblio::IO::medline2ref) perl(Bio::Biblio::IO::medlinexml) perl(Bio::Biblio::IO::pubmed2ref) perl(Bio::Biblio::IO::pubmedxml) perl(Bio::Biblio::Journal) perl(Bio::Biblio::JournalArticle) perl(Bio::Biblio::MedlineArticle) perl(Bio::Biblio::MedlineBook) perl(Bio::Biblio::MedlineBookArticle) perl(Bio::Biblio::MedlineJournal) perl(Bio::Biblio::MedlineJournalArticle) perl(Bio::Biblio::Organisation) perl(Bio::Biblio::Patent) perl(Bio::Biblio::Person) perl(Bio::Biblio::Proceeding) perl(Bio::Biblio::Provider) perl(Bio::Biblio::PubmedArticle) perl(Bio::Biblio::PubmedBookArticle) perl(Bio::Biblio::PubmedJournalArticle) perl(Bio::Biblio::Ref) perl(Bio::Biblio::Service) perl(Bio::Biblio::TechReport) perl(Bio::Biblio::Thesis) perl(Bio::Biblio::WebResource) perl(Bio::Cluster::ClusterFactory) perl(Bio::Cluster::FamilyI) perl(Bio::Cluster::SequenceFamily) perl(Bio::Cluster::UniGene) perl(Bio::Cluster::UniGeneI) perl(Bio::ClusterI) perl(Bio::ClusterIO) perl(Bio::ClusterIO::dbsnp) perl(Bio::ClusterIO::unigene) perl(Bio::CodonUsage::IO) perl(Bio::CodonUsage::Table) perl(Bio::ConfigData) perl(Bio::Coordinate::Chain) perl(Bio::Coordinate::Collection) perl(Bio::Coordinate::ExtrapolatingPair) perl(Bio::Coordinate::GeneMapper) perl(Bio::Coordinate::Graph) perl(Bio::Coordinate::MapperI) perl(Bio::Coordinate::Pair) perl(Bio::Coordinate::Result) perl(Bio::Coordinate::Result::Gap) perl(Bio::Coordinate::Result::Match) perl(Bio::Coordinate::ResultI) perl(Bio::Coordinate::Utils) perl(Bio::DB::Ace) perl(Bio::DB::Biblio::biofetch) perl(Bio::DB::Biblio::eutils) perl(Bio::DB::Biblio::pdf) perl(Bio::DB::Biblio::soap) perl(Bio::DB::BiblioI) perl(Bio::DB::BioFetch) perl(Bio::DB::CUTG) perl(Bio::DB::DBFetch) perl(Bio::DB::EMBL) perl(Bio::DB::EUtilities) perl(Bio::DB::EUtilities::Cookie) perl(Bio::DB::EUtilities::ElinkData) perl(Bio::DB::EUtilities::efetch) perl(Bio::DB::EUtilities::egquery) perl(Bio::DB::EUtilities::einfo) perl(Bio::DB::EUtilities::elink) perl(Bio::DB::EUtilities::epost) perl(Bio::DB::EUtilities::esearch) perl(Bio::DB::EUtilities::esummary) perl(Bio::DB::EntrezGene) perl(Bio::DB::Expression) perl(Bio::DB::Expression::geo) perl(Bio::DB::Failover) perl(Bio::DB::Fasta) perl(Bio::DB::Fasta::Stream) perl(Bio::DB::FileCache) perl(Bio::DB::Flat) perl(Bio::DB::Flat::BDB) perl(Bio::DB::Flat::BDB::embl) perl(Bio::DB::Flat::BDB::fasta) perl(Bio::DB::Flat::BDB::genbank) perl(Bio::DB::Flat::BDB::swiss) perl(Bio::DB::Flat::BDB::swissprot) perl(Bio::DB::Flat::BinarySearch) perl(Bio::DB::GDB) perl(Bio::DB::GFF) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::ace) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb::iterator) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch_oracle) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::caching_handle) perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::faux_dbh) APPROVED. -- Configure bugmail: https://bugzilla.redhat.com/bugzilla/userprefs.cgi?tab=email ------- 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